Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms