Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms