Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGGTAQ92696 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
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