Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms