Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms