Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms