Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms