Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms