Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms