Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms