Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
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