Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms