Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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