Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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