Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms