Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms