Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms