Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HBBP68871 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HBBP68871 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HBBP68871 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HBBP68871 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HBBP68871 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HBBP68871 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HBBP68871 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HBBP68871 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HBBP68871 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HBBP68871 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HBBP68871 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HBBP68871 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HBBP68871 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HBBP68871 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HBBP68871 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HBBP68871 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HBBP68871 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HBBP68871 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms