Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms