Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms