Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN5O75503 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN5O75503 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN5O75503 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN5O75503 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN5O75503 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN5O75503 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN5O75503 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN5O75503 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN5O75503 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN5O75503 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN5O75503 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN5O75503 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN5O75503 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN5O75503 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN5O75503 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN5O75503 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN5O75503 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN5O75503 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN5O75503 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN5O75503 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN5O75503 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN5O75503 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLN5O75503 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLN5O75503 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLN5O75503 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLN5O75503 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLN5O75503 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLN5O75503 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLN5O75503 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN5O75503 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms