Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms