Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms