Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms