Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E9PBE3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E9PBE3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E9PBE3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E9PBE3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E9PBE3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E9PBE3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E9PBE3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E9PBE3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E9PBE3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E9PBE3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E9PBE3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E9PBE3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E9PBE3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E9PBE3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E9PBE3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E9PBE3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E9PBE3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E9PBE3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E9PBE3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E9PBE3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E9PBE3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E9PBE3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E9PBE3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E9PBE3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
E9PBE3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E9PBE3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
E9PBE3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E9PBE3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
E9PBE3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E9PBE3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E9PBE3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E9PBE3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E9PBE3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E9PBE3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E9PBE3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E9PBE3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E9PBE3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E9PBE3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
E9PBE3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E9PBE3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E9PBE3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E9PBE3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E9PBE3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E9PBE3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E9PBE3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E9PBE3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E9PBE3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E9PBE3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E9PBE3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E9PBE3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E9PBE3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E9PBE3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E9PBE3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E9PBE3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
E9PBE3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
E9PBE3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
E9PBE3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
E9PBE3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
E9PBE3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
E9PBE3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
E9PBE3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
E9PBE3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
E9PBE3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms