Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms