Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms