Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms