Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms