Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms