Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms