Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIN28AQ9H9Z2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms