Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8W2

LINC00472, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00472, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00472Q9H8W2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00472Q9H8W2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms