Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms