Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms