Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms