Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS2Q9BXC9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms