Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM2Q9BVW6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM2Q9BVW6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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