Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms