Protein–RNA interactions for Protein: Q99942

RNF5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF5Q99942 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms