Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms