Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms