Protein–RNA interactions for Protein: Q92466

DDB2, DNA damage-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2Q92466 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms