Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF12Q8WXF0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms