Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHA9Q7RTU4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHA9Q7RTU4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms