Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CASC1Q6TDU7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASC1Q6TDU7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms