Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC41PQ6P2S7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms