Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms