Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF18Q5VWM3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms