Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms